Агенты Щ. И. Т.

Гаррет убивает одного из генералов США, пришедших на переговоры с «Г.И.Д.Р.ой», и захватывает остальных. Колсону с его людьми удаётся захватить центр соединения солдат-«сороконожек». Фитц и Симмонс удаётся всплыть на поверхность, где их неожиданно спасает Ник Фьюри, нашедший их по сигналу маячка. Мэй и Уорд вступают в схватку, и Мэй побеждает. Майкл узнаёт, что его сын свободен, и прибивает Гаррета. Гаррет смог это пережить и усилил себя кибер-имплантатами, и тут Колсон убивает его окончательно. Фьюри передаёт Колсону пост директора «Щ.И.Т.а».Рейна сообщает отцу Скай, что нашла её.

Агенту Колсону нужны хоть какие-то сведения о Гаррете и «Г.И.Д.Р.е», поэтому он вместе со своей командой проникает в здание «Кибиртек». Скай пытается найти компьютер, чтобы загрузить вирус и скачать нужные сведения, но оказывается, что все данные компании хранятся в бумажном виде. Колсон и Мэй сбегают вместе с нужными бумагами и прочтя их узнают, что Гаррет является первым объектом "Детлок". Между действиями нам показываются эпизоды из прошлого Уорда и становится понятно, почему он всем обязан Гаррету. Команда Колсона находит свой самолет на Кубе и отправляется туда. По прибытию они разделяются на две группы, первая ищет старую базу «Щ.И.Т.а», а Фитц и Симмонс ищут самолет. Фитца вместе с Симмонс захватывает Уорд и доставляется к Гаррету, Фитц не растерялся и использовал мини-ЭМИ устройство, чтобы отключиться Гаррета. Вместе с Симмонс они сбегают и прячутся в одном из модулей самолета, но Гаррет просит Уорда убить их и Уорд выполняет просьбу. В этом время Рейна вводит Гаррету GH-235.

В кафе, где Скай якобы пытается расшифровать данные, она выдаёт Уорда полицейским и пытается сбежать. Уорд справляется с полицией и с помощью Майка хватает Скай, которую вынуждают расшифровать данные. Колсон помогает Скай сбежать. Мэй приносит Колсону информацию о проекте «Таити».

Уорду нужен ключ от винчестера с исследованиями Симмонс, зашифрованного Скай. Для этого он добирается до секретной базы директора Фьюри, где находится команда. Все проходят проверку на детекторе лжи, где Уорд чуть не попадается. В это же время Колсон и часть команды собирается разыскать преступника из Холодильника, обладающего некой силой "черной материи" и охотящегося за виолончелисткой. Мэй решает покинуть команду и ушла в свободный путь. В итоге Скай узнает, что Уорд из организации «Г.И.Д.Р.А.»., но садится с ним на самолет не подавая вида...

«Г.И.Д.Р.А.» продолжает активные действия в захвате «Щ.И.Т.а». Рейну освобождают и она узнает правду о Провидце, который просит ее продолжить проект "Многоножка". Уорд предоставляет ей все наработки Симмонс в этом направлений, а сам вместе с Гарретом отправляется на штурм Холодильника. Колсон и его команда вынуждены искать убежища. Их дела обстоят хуже некуда: самолет в плохом состоянии, лететь некуда, верить никому нельзя и сами они уже словно призраки. Но тут обнаруживается один интересный факт...Есть спрятанное убежище,которое до сх пор принадлежит Щ.И.ТуВ то же время Рейна сообщает Гаррету, что винчестер с нужными ей данными защищен. И защищен именно Скай. Теперь Уорд вынужден решить эту проблему.

События эпизода происходят во время фильма «Первый мститель: Другая война». «Г.И.Д.Р.А.» активизируется и захватывает «Щ.И.Т.». Виктория Хэнд подозревает Колсона в участии в организации «Г.И.Д.Р.А.». Колсон раскрывает личность Провидца: им оказывается агент «Щ.И.Т.а» Джон Гаррет, оказалось, что Провидец— член организации «Г.И.Д.Р.А.», Виктория всё слышала и сняла обвинение. Провидца хватают и хотят убить, но Уорд переходит на сторону Гаррета и убивает Викторию Хэнд.

Провидца выслеживают и убивают, но возникают сомнения: действительно ли это был Провидец или только подставное лицо? Возникает подозрение, что Мэй работает на Провидца. Тем временем управление самолётом перехватывается извне.

Команда имеет дело с Сиф, воительницей, соратницей Тора. Сиф прибыла на Землю из Асгарда, чтобы поймать сбежавшую из заключения Лорелей. Сложность заключается в том, что ни один мужчина не сможет противиться её чарующему голосу. Отношения между Мэй и Уордом уже не будут казаться такими непринуждёнными.

Умирающую Скай доставляют в больницу, но повреждения слишком серьезные. Скай фактически существует за счет медоборудования и в любой момент может скончаться. Фил Колсон и Команда решаются на отчаяный шаг — найти объект «Таити», где Колсона вернули к жизни и повторить это со Скай. К ним присоединяется учитель Уорда и его новый ученик, агент Триплетт, которым поручено допросить Йена Куинна. В конце концов Колсон выясняет, откуда берётся таинственный препарат, возвращающий жизнь. На Землю прибывает асгардийка Лорелей.

Команда выслеживает перевозку неопознанного секретного устройства (0-8-4) с целью доставить его бизнесмену, а также одному из людей Провидца Йену Куинну и отправляется по следам этого маршрута. В ходе операции Скай, которая на самом деле также является «0-8-4», оказывается раненой Куинном и чуть не умирает от потери крови.

Фитц и Симмонс вместе с Уордом и Скай отправляются в университет «Щ.И.Т.а», где готовят будущих учёных и оперативников организации, чтобы разобраться в таинственных происшествиях, связанных с «замораживанием» некоторых студентов. Тем временем Колсон и Мей находят человека, который знает, кем на самом деле является Скай, и раскрывает «Щ.И.Т.у» некоторые моменты детства хакерши.

Рейна пытается выяснить, как Колсон смог вернуться к жизни после своей смерти, и добивается успеха в этом. Тем временем, «Щ.И.Т.» готовит спасательную операцию, в ходе которой похищенного агента освобождают, а Рейну берут под стражу. Колсон, к которому вернулись воспоминания о дне его смерти, осознаёт, что его «воскресили» с помощью неизвестных технологий «Щ.И.Т.а», и затем пытается узнать больше у одного из участников той самой процедуры.

«Щ.И.Т.» вновь сталкивается с проектом «Сороконожка», когда Рейна вместе с недавно освобождённым из тюрьмы подельником отправляется к таинственному Ясновидящему, который может дать «ключ» к продолжению их экспериментов по созданию новых суперсолдат. Тем временем Колсон выходит на Майка Петерсона, который был одним из первых подопытных, но Рейна, похитив его сына, вынуждает Майка сдать Колсона «Сороконожке». Когда агент оказывается схвачен, «девушка в цветочном платье» раскрывает Колсону цель его похищения: узнать, каким образом он когда-то остался жив, хоть должен был умереть.

Щ.И.Т. выслеживает Ханну Хатчинс, женщину, которая обвиняется в провоцировании нескольких взрывов в результате несдержанной силы телекинеза, которой якобы владеет. По ходу расследования выясняется, что Ханна не имеет никаких суперспособностей, а взрывы были осуществлены в результате открытой «двери» из ада в мир людей, и через эти двери в наш мир проник некий «человек-призрак». Теперь Колсону со своей группой нужно разобраться в паранормальных вещах, происходящих вокруг Ханны…

Эпизод, являющийся привязкой к ​​фильму «Тор 2: Царство тьмы», где команда наводит порядок после событий фильма, а также ищет Асгардский скипетр Берсерков, оставленный на Земле.

Команда отправляется в так называемый «Штаб» Щ.И.Т.а, где Ворд и Фитц получают новое задание восьмого уровня, к которому из-за секретности не допускают Скай. Заручившись помощью Симмонс, девушка пытается выяснить все секреты миссии, попутно разыскивая информацию по своим родителям.

После битвы за Нью-Йорк (события фильма «Мстители») на Земле остался шлем побеждённой супергероями расы Читаури. Именно его и находят пожарные, которым от него передаётся вирус, уничтожающий людей изнутри. В ходе расследования происшествий, связанных со шлемом, носителем вируса становится один из людей Колсона. Теперь группе предстоит быстро найти лекарство...

Работница проекта «Сороконожка» Рэйна (девушка в цветочном платье) выслеживает сверхчеловека, способного создавать огонь, и предлагает ему расширить свою силу и стать новым супергероем, Ожогом. Щ.И.Т. начинает разыскивать мутанта, также пытаясь ближе подобраться к проекту, создающему «супергероев». Тем временем, выясняются реальные мотивы присутствия Скай в организации

Команда расследует профессиональную кражу бриллиантов и находит вора: им оказывается Акелла Амадор, бывший агент Щ.И.Т.а. Вскоре выясняется, что Акелла на самом деле лишь «оружие» в руках некой преступной организации, в том числе промышляющей похищением важной информации.

Щ.И.Т. отправляется на поиски одного из своих активов, доктора Франклина Холла, который был похищен его бывшим партнером по исследованиям Иеном Куинном. Он хочет использовать Холла, чтобы взять под контроль гравитацию планеты. Скай предстоит проникнуть прямиком в особняк Куинна, чтобы команда Колсона могла спасти Холла.

Колсон и его команда отправляются в Перу, чтобы исследовать некое устройство инопланетного происхождения, имеющее связь с Тессерактом. Между тем, новичок в команде, хакерша Скай, на самом деле является также агентом «Rising Tide».

Агент Фил Колсон набирает группу для борьбы с преступной организацией «Rising Tide», одновременно сталкиваясь с новой угрозой, когда в Нью-Йорке начинают появляться сверхлюди, подопытные проекта «Сороконожка». Щ.И.Т. выходит на след эксцентричного борца за свободу информации Скай, которая соглашается вступить в ряды организации и в команду Колсона.